广州市林业和园林科学研究院, 广州, 510405
作者 通讯作者
《分子植物育种》印刷版, 2022 年, 第 20卷, 第 9 篇
收稿日期: 2020年10月19日 接受日期: 2020年11月03日 发表日期: 2022年09月14日
作者 通讯作者
《分子植物育种》印刷版, 2022 年, 第 20卷, 第 9 篇
收稿日期: 2020年10月19日 接受日期: 2020年11月03日 发表日期: 2022年09月14日
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摘 要
MADS-box蛋白作为一种重要的转录因子,调控扁桃生殖和营养生长,分析鉴定扁桃 MADS-box基因家族,可以为探究扁桃生物学功能提供铺垫。基于扁桃基因组数据,通过 HMMER 3.0 软件分析扁桃的MADS-box 基因 Type玉型及 MIKC 型,使用MEGA 7.0、MEME完成染色体定位、基因结构和 Motif 预测分析。在全基因组水平本研究一共鉴定出65 个扁桃MADS-box 基因,染色体定位发现这些基因分布在八条染色体上,motif 结果显示所有 MADS-box蛋白中都有 MADS 结构域的存在,基因结构分析发现,外显子、内含子结构和长度在亚组表现一致。本研究利用生物信息学分析手段,鉴定了扁桃 MADS-box基因家族,获得扁桃开花和生长发育的相关基因,对发现扁桃开花器官的生长发育等一系列的重要性状和分子育种提供了重要的理论与应用价值。
关键词
扁桃;MADS-box基因家族;生物信息学;系统进化树