研究报告

薄壳山核桃Aux/IAA基因家族全基因组鉴定及其在嫁接愈合中的表达分析  

范平桦1,2 , 朱凯凯1,2 , 谭鹏鹏1,2 , 彭方仁1,2 , 李永荣3
1 南京林业大学, 南方现代林业协同创新中心, 南京, 210037; 2 南京林业大学林学院, 南京, 210037; 3 南京绿宙薄壳山核桃科技有限公司, 南京, 211500
作者    通讯作者
《分子植物育种》印刷版, 2022 年, 第 20卷, 第 13 篇   
收稿日期: 2020年10月18日    接受日期: 2020年11月03日    发表日期: 2022年04月28日
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摘 要

Aux/IAA (Auxin/Indole- 3- Acetic Acid)家族是生长素信号的早期响应基因家族之一,广泛参与调控植物的生长发育过程。薄壳山核桃(Carya illinoinensis)作为一种重要经济树种,对其Aux/IAA家族基因的鉴定具有重要意义。本研究利用生物信息学方法,在薄壳山核桃中共鉴定到 37Aux/IAA基因,并且发现其成员全部定位于细胞核。根据其与拟南芥Aux/IAA基因的系统发育关系,将37个薄壳山核桃Aux/IAA基因分为AB两组。多重序列比对分析发现薄壳山核桃Aux/IAA蛋白具有 4 个保守结构域,分别为I-IV。顺式作用元件分析发现所有薄壳山核桃Aux/IAA基因启动子区域都具有响应激素的作用元件。根据薄壳山核桃Aux/IAAs在嫁接愈合中的表达模式,挖掘出4个高表达基因,它们可能在嫁接愈合过程中起重要作用。本研究将有助于阐明薄壳山核桃Aux/IAAs在嫁接愈合过程中的功能并筛选候选基因。

关键词
薄壳山核桃;Aux/IAA; 嫁接;表达模式
《分子植物育种》印刷版
• 第 20 卷
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