研究报告

基于转录组数据挖掘桑树bHLH转录因子家族  

李季生 , 李娜 , 贾漫丽 , 王彬彬 , 范伟 , 夏爱华
承德医学院蚕业研究所, 河北省高校特产蚕桑应用技术研发中心, 承德, 067000
作者    通讯作者
《分子植物育种》印刷版, 2022 年, 第 20卷, 第 7 篇   
收稿日期: 2020年10月02日    接受日期: 2020年10月17日    发表日期: 2022年03月28日
© 2022 BioPublisher 生命科学中文期刊出版平台
这是一篇采用Creative Commons Attribution License进行授权的开放取阅论文。只要对本原作有恰当的引用,版权所有人允许和同意第三方无条件的使用与传播。
摘 要

bHLH转录因子在植物生长发育调节、生物/非生物胁迫应答以及次生代谢过程中发挥着重要的调控作用,但有关桑树bHLH转录因子的报道还相对较少,不利于开展相关方面的探索。本研究借助生物信息学技术鉴定到54个桑树bHLH转录因子,并对其保守序列、基因结构、蛋白进化和组织表达进行了分析。结果表明,桑树bHLH转录因子含有2个保守功能域,位于N端的碱性区域和C端的HLH区域。N端的碱性区域由12个氨基酸残基组成,其中第9位和第10位上的精氨酸具有较强的保守性;C端的HLH区域由45个氨基酸组成,第2050位上的亮氨酸高度保守,可能与二聚体的形成有关。在基因结构方面,大部分转录因子均含有内含子结构,相位类型有23种,以00-0型为主,各有10个基因。从蛋白家族系统进化上看,桑树bHLH蛋白与同源性较近的拟南芥序列交错排布,被划分在4个大的进化组中。多数基因在桑树的根、皮、冬芽、雄花和叶片中均有表达,5个基因具有明显的组织特异性,但表达量较低。本研究为进一步开展桑树bHLH转录因子的功能研究提供了理论依据。

关键词
桑树;bHLH 转录因子;生物信息学分析; 组织表达;转录组
《分子植物育种》印刷版
• 第 20 卷
阅览选项
. 全文 PDF
. 全文 HTML
读者评论
. 评论
作者的其他论文
.
李季生
.
李娜
.
贾漫丽
.
王彬彬
.
范伟
.
夏爱华
相关论文
.
桑树
.
bHLH 转录因子
.
生物信息学分析
.
组织表达
.
转录组
服务
. 发表评论