刘思思^1,2* , 乔中全^2* , 曾慧杰² , 李永欣² , 蔡能² , 刘新民^2** , 王晓明^1,3**

1湖南中医药大学中西医结合学院,长沙, 410208; 2湖南省林业科学院长沙市木本花卉工程技术研究中心,长沙, 410004; 3中国医学科学院北京协和医学院药用植物研究所,北京, 100193
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《分子植物育种》印刷版, 2021 年, 第 19卷, 第 27 篇   
收稿日期: 2020年09月22日    接受日期: 2020年09月25日    发表日期: 2021年06月27日

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灰毡毛忍冬(Lonicera macranthoides)为中药山银花的一种基原植物，在中国南方广泛分布，具有很高的药用价值和经济价值。本研究利用 MISA工具对灰毡毛忍冬转录组 74 057条 Unigenes中的 SSR位点进行了分析，其中 15 587条 Unigene共计含有 SSR位点 20 161个，SSR发生频率为 21.05%。灰毡毛忍冬转录组 SSR位点的种类从单核苷酸至六核苷酸重复均有分布，主要重复类型是二核苷酸(9 704个)和三核苷酸(5 847个)，分别占 SSR总数的 48.13%和 29.00%，主要重复单元为 AG/CT (6 086)、AT/AT (3 071)和 A/T(2 826)，分别占 SSR总数的 30.19%、15.23%和 14.02%。SSR位点的重复次数分布最多的是 6和 5次，分别有 4 897和 3 531个，分别占总 SSR数的 24.29%和 17.51%。利用 Primer 6.0软件设计了 17 611对 SSR引物，随机选出 30对引物进行扩增验证，其中 14对扩增条带表现出多态性，进而利用这 14对引物对 6个灰毡毛忍冬品种开展了遗传多样性分析。本研究结果将为灰毡毛忍冬物种鉴定、遗传多样性分析和分子标记辅助育种等提供科学依据。
 

灰毡毛忍冬(Lonicera macranthoides)；SSR；分子标记；转录组