张藉粱 , 陈红 , 安华明 , 鲁敏^*

贵州大学农学院, 贵州省果树工程研究中心, 贵阳, 550025
作者    通讯作者
《分子植物育种》印刷版, 2022 年, 第 20卷, 第 11 篇   
收稿日期: 2020年09月20日    接受日期: 2020年09月28日    发表日期: 2022年08月02日

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同源异型域 - 亮氨酸拉链蛋白(homeodomain-leucine-zipper, HD-Zip)作为高等植物所特有的一种转录因子，参与了高等植物形态建成、生长发育和逆境调控。本研究采用生物信息学方法，旨在鉴定和注释森林草莓中 HD-Zip Ⅳ亚基因家族的全基因组序列，分析 FvH4HDZIV 基因的系统和分子进化，明确 HD-Zip Ⅳ基因的分布，同时分析 FvH4HDZIV 基因结构与其启动子顺式调控元件。结果表明，森林草莓中预测具有8个 HD-Zip Ⅳ基因，氨基酸的长度范围为 698~830，分子量范围为 78 060.90 ~89 980.74 kD，等电点为 5.4~7.52，亚细胞定位得到 FvH4HDZI 蛋白均定位于细胞核；本试验获得的 8 个目标基因分散在森林草莓 7 条染色体中的 5 条染色体上，LG2 和 LG4 上无 FvH4HDZIV 基因的分布，在连锁群 1、5、7 上均定位了 2 个FvH4HDZIV 基因；通过建立系统进化树进行进一步分析，发现的 FvH4HDZIV8 位于Ⅰ-a，FvH4HDZIV2 和FvH4HDZIV4 位于Ⅲ-a，FvH4HDZIV1 和 FvH4HDZIV3 位于Ⅴ-a 中；同时，所有成员都有内含子，内含子的数目在 8~12，数目相对稳定，且数量较多，内含子相位分析结果表明大多数内含子采用相位 0 方式剪接；此外，通过对启动子调控元件分析发现，森林草莓 HD-Zip Ⅳ基因启动子区域存在多种调控元件，由此可推测，它们可以被多种转录因子以及各种内源和外源因素调控，从而参与生物体的各种功能。本研究结果为HD-Zip Ⅳ基因家族参与森林草莓生物功能的进一步研究提供了生物信息学参考依据。

森林草莓；HD-Zip Ⅳ家族；鉴定与分析