1浙江省萧山棉麻研究所,浙江省园林植物与花卉研究所,杭州, 311251; 2杭州市萧山区农业科学技术研究所,杭州, 311202; 3华中农业大学植物科学技术学院,武汉, 430070
作者 通讯作者
《分子植物育种》印刷版, 2022 年, 第 20卷, 第 4 篇
收稿日期: 2020年09月16日 接受日期: 2020年09月25日 发表日期: 2022年07月18日
作者 通讯作者
《分子植物育种》印刷版, 2022 年, 第 20卷, 第 4 篇
收稿日期: 2020年09月16日 接受日期: 2020年09月25日 发表日期: 2022年07月18日
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摘 要
洋桔梗(Eustoma grandiflorum)是一种原产于北美的重要观赏植物。到目前为止,关于洋桔梗的基础分子研究报道相对较少,特别是响应干旱胁迫的分子机制相关研究。本试验利用转录组二代测序技术对干旱胁迫下的洋桔梗幼苗进行了研究。结果表明,该转录组测序数据具有良好的质量控制结果。为了在此基础上获得基因信息,利用 Trinity和 Corset等软件将序列进行了拼接,共得到 102 014条非冗余基因,其中包含2 929条编码基因,经分析发现分属于 79个转录因子家族。对所有基因进行注释,发现比对相似度最高的物种是中果咖啡。最后,对基因序列进行简单序列重复(simple sequence repeat, SSR)分析,获得了所有非冗余基因以及转录因子编码基因所包含的 SSR信息。本研究结果可为后续针对洋桔梗响应干旱胁迫的相关研究提供候选分子资源。
关键词
洋桔梗(Eustoma grandiflorum);干旱胁迫;转录组