中国林业科学研究院,经济林研究开发中心,国家林业和草原局泡桐研究开发中心,经济林种质创新与利用国家林业和草原局重点实验室,郑州,450003
作者 通讯作者
《分子植物育种》印刷版, 2021 年, 第 19卷, 第 14 篇
收稿日期: 2020年07月30日 接受日期: 2020年08月07日 发表日期: 2021年12月26日
作者 通讯作者
《分子植物育种》印刷版, 2021 年, 第 19卷, 第 14 篇
收稿日期: 2020年07月30日 接受日期: 2020年08月07日 发表日期: 2021年12月26日
© 2021 BioPublisher 生命科学中文期刊出版平台
这是一篇采用Creative Commons Attribution License进行授权的开放取阅论文。只要对本原作有恰当的引用,版权所有人允许和同意第三方无条件的使用与传播。
摘 要
为探明调控西伯利亚杏(Prunus sibirica)成花的分子机制,筛选参与调控开花的相关候选基因,本研究以两个不同时期的西伯利亚杏花芽为样本进行转录组测序,共获得 42.04 Gb高质量数据,平均 95.6%的数据均可以比对上参考基因组。共筛选出 6 850个显著差异表达基因,其中在花芽萌动期上调表达基因有 2 784个,下调表达基因 4 066个,花芽萌动期特异表达基因 392个,盛花期特异表达基因 346个。KEGG富集结果表明差异表达基因在植物激素信号转导、苯丙素生物合成、淀粉和蔗糖代谢等代谢通路被富集最多。另外,本研究共发现 39个显著差异表达基因涉及植物开花调控的相关途径,主要包括:春花途径相关基因中 10个、光周期途径相关基因 17个、自主途径相关基因 5个、霉素途径相关基因 1个、温度途径相关基因 2个,整合因子(SOC1, FT, LFY)共 4个。研究结果可为西伯利亚杏开花调控提供了重要的候选基因,对西伯利亚杏育种具有一定的参考价值。
关键词
西伯利亚杏;开花调控;差异表达基因;转录组