赖正锋^* , 姚运法^* , 林碧珍 , 练冬梅 , 洪建基^**

福建省农业科学院亚热带农业研究所,漳州, 363005
作者    通讯作者
《分子植物育种》印刷版, 2021 年, 第 19卷, 第 5 篇   
收稿日期: 2020年07月23日    接受日期: 2020年08月03日    发表日期: 2021年12月21日

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利用二代高通量测序技术对低温胁迫处理的冰菜进行测序，构建冰菜转录组数据库。分别得到24.13 Gb有效数据和 24 045条 Unigene的注释，得到 DEGs 1 902个(T0 vs T1)和 2 134个(T0 vs T2)。T0 vs T1组和 T0 vs T2组分别有 40和 41个功能小类化归 GO数据库；分别有 20和 24个功能分类注释到 KOG数据库；155和 272条基因注释到 KEGG数据库，并分别富集在 74和 105条代谢通路。T0 vs T1组 DEGs主要注释到植物信号转导等 4个代谢通路；T0 vs T2组 DEGs注释到苯丙醇类生物合成等 11个代谢通路，其中正向影响代谢途径：丙酮醇类生物合成、嘌呤代谢、谷胱甘肽代谢、脂肪酸代谢、类黄酮代谢、氨基酸的生物合成代谢途径等；负向影响代谢途径：植物 - 病原互作、植物激素信号转导、淀粉和蔗糖代谢等途径。通过对淀粉和蔗糖代谢途径关键基因分析表明：低温胁迫 1 h (T1)，海藻糖 6- 磷酸合酶、海藻糖 -6- 磷酸酯酶、β- 淀粉酶、葡萄糖 -1- 磷酸腺苷酰转移酶、糖原磷酸化酶等 5个关键基因表现为上调表达，未见下调表达基因；低温胁迫 36 h (T2)，海藻糖 -6- 磷酸合酶、己糖激酶、β- 淀粉酶等 3个关键基因上调表达，葡萄糖内酯 -1,3-β-葡萄糖苷酶基因下调表达。选取淀粉和蔗糖代谢途径中 8个 DEGs，经 RT-qPCR分析，8个 DEGs的相对表达量与转录组表达水平相符。

冰菜；转录组；差异表达基因；淀粉和蔗糖代谢