研究报告

基于 RAD 测序的全基因组 SNPs 揭示‘桂林柳叶菜花’与芸薹属亲缘关系  

刘凤琼* , 武晓晓 , 李海炎 , 王红梅 , 贺申魁
广西特色作物研究院, 桂林, 541004
作者    通讯作者
《分子植物育种》印刷版, 2021 年, 第 19卷, 第 22 篇   
收稿日期: 2020年06月30日    接受日期: 2020年07月10日    发表日期: 2022年03月04日
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摘 要

为了研究‘桂林柳叶菜花’与芸薹属的亲缘关系,本研究以‘桂林柳叶菜花’与芸薹属的不同品种共30 份种质资源为试验材料,采用单核苷酸多态性技术分析遗传多样性、群体结构、进化方向。结果表明,利用生物信息学分析重测序数据,获得 103 G 高质量数据,共检测到 6 873 195 SNP,其中‘桂林柳叶菜花’检测到 219 463 SNP。基于 SNP 标记获得的进化树在遗传距离 0.003 处将 30 份种质资源分为两大组,在0.036 处,‘桂林柳叶菜花’所在的组又被分为三个小组,可以看出芸薹属不同品种之间的遗传多样性。其中,‘桂林柳叶菜花’与‘十月鲜红菜苔’、‘无渣四九菜心’最先聚为一组,遗传距离最小,表明三者亲缘关系最近,进而与‘甜脆小白菜’等聚类为一组,表明‘桂林柳叶菜花’与此两种类型也有一定的亲缘关系,主成分分析(PCA)与群体结构分析获得了与进化树一致的结果。研究结果体现了芸薹属不同品种的遗传多样性;推测‘桂林柳叶菜花’是一个经过长期演变而形成的一个纯度较高的地方品种,不存在与甘蓝类或芥菜类的杂交。本研究为‘桂林柳叶菜花’在当前主流的芸薹属作物中建立起了亲缘关系网,为今后新的品种材料的创制以及新品种的选育提供依据。

关键词
芸薹属(Brassica);柳叶菜花;重测序;遗传进化
《分子植物育种》印刷版
• 第 19 卷
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