华北理工大学生命科学学院, 唐山, 063000
作者 通讯作者
《分子植物育种》印刷版, 2021 年, 第 19卷, 第 1 篇
收稿日期: 2020年06月18日 接受日期: 2020年06月26日 发表日期: 2021年09月25日
作者 通讯作者
《分子植物育种》印刷版, 2021 年, 第 19卷, 第 1 篇
收稿日期: 2020年06月18日 接受日期: 2020年06月26日 发表日期: 2021年09月25日
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摘 要
三结构域多铜氧化酶(Three-domain multi-copper oxidase)是多铜氧化酶超基因家族中最大的一个家族,具有多种生物学功能。本研究利用比较基因组学方法对谷子(Setaria italica)中该家族进行了全基因组学分析,结果显示,谷子三结构域多铜氧化酶基因家族发生了大规模扩张,主要是由谷子物种形成后该基因家族成员的串联重复所导致。谷子三结构域多铜氧化酶基因分为Ⅰ、Ⅱ、Ⅲ三个类群,串联重复基因主要集中在 ClassⅠ-7 亚类,对这一亚类基因进行选择压力分析发现 7 个氨基酸位点受到正选择。谷子三结构域多铜氧化酶能响应多种逆境胁迫,ABA 和 PEG 处理下该类基因的表达整体呈上调模式,热胁迫下整体呈下调模式,且差异表达基因具有类群聚集现象,冷胁迫和盐胁迫下也有多个基因显著差异表达。本研究揭示了谷子三结构域多铜氧化酶基因家族的进化规律,并为深入研究该基因的功能提供线索。
关键词
谷子;三结构域多铜氧化酶;基因家族;比较基因组学;非生物胁迫