东北农业大学生命科学学院,哈尔滨, 150030
作者 通讯作者
《分子植物育种》印刷版, 2021 年, 第 19卷, 第 6 篇
收稿日期: 2020年05月30日 接受日期: 2020年06月08日 发表日期: 2021年12月21日
作者 通讯作者
《分子植物育种》印刷版, 2021 年, 第 19卷, 第 6 篇
收稿日期: 2020年05月30日 接受日期: 2020年06月08日 发表日期: 2021年12月21日
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摘 要
为探究番茄 CRT基因家族成员信息和在不同胁迫下的响应情况,本研究以拟南芥 CRT氨基酸序列为参照,通过 tblastn方法共发掘出 3个番茄CRT 基因,其氨基酸长度在 413 aa到 433 aa之间,分子量在47.6 kD到 50.9 kD之间;构建系统进化树发现,番茄 CRT基因家族可分为两个亚族,CRT3 和CRT4 为同一亚族;亚细胞定位结果表明,番茄CRT 基因主要存在于细胞核和内质网上;基因结构分析说明番茄 CRT基因家族成员都富含内含子;对番茄 CRT基因家族成员启动子上游 2 000 bp碱基分析发现,番茄 CRT基因家族可能会响应多种逆境胁迫,同时番茄 CRT可与多种蛋白互作;通过 RT-qPCR发现,CRT 基因在各组织当中表达含量会有所差异,且番茄CRTs 对各种胁迫反应都能做出相应反应。本研究结果对后续解析CRT 基因在番茄中的生物学功能奠定了基础。
关键词
番茄;CRTs 基因;生物信息学分析;逆境胁迫