研究报告

牡丹 TCP家族基因的鉴定与生物信息学分析  

张延召 , 罗新 , 李会云* , 段旭佳 , 张妍
洛阳师范学院生命科学学院,洛阳, 471934
作者    通讯作者
《分子植物育种》印刷版, 2022 年, 第 20卷, 第 5 篇   
收稿日期: 2020年05月27日    接受日期: 2020年06月05日    发表日期: 2022年07月18日
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摘 要

TCP (Teosinte branched1/Cincinnata/proliferating cell factor)家族基因是植物特有的一类转录因子,在植物生长发育的过程中具有重要的调控作用。本研究从牡丹转录组数据中鉴定出 18TCP 基因,分子量在 18 978.32~51 789.56 Da之间,等电点在 5.81~9.45之间,TCP家族成员亚细胞定位预测均在细胞核中。牡丹 TCP结构域中保守氨基酸的分类与拟南芥相似,系统发育分析结果表明,牡丹 TCP蛋白分为两大类,Class包含 10TCP成员,Class包含 8TCP成员。MEME分析结果显示,在牡丹 TCP蛋白中发现了15个保守结构域,其中 motif 1TCP结构域,在所有 TCP成员中都存在。同时,对牡丹TCP 基因在芽、叶、花瓣、花斑、雄蕊、雌蕊和种子 7个组织中的转录水平进行了分析。本研究对牡丹 TCP家族基因进行了系统的分析,为进一步开展牡丹功能基因研究及分子育种提供了科学依据。

关键词
牡丹;TCP家族基因;TCP结构域
《分子植物育种》印刷版
• 第 20 卷
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