洛阳师范学院生命科学学院,洛阳, 471934
作者 通讯作者
《分子植物育种》印刷版, 2022 年, 第 20卷, 第 5 篇
收稿日期: 2020年05月27日 接受日期: 2020年06月05日 发表日期: 2022年07月18日
作者 通讯作者
《分子植物育种》印刷版, 2022 年, 第 20卷, 第 5 篇
收稿日期: 2020年05月27日 接受日期: 2020年06月05日 发表日期: 2022年07月18日
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摘 要
TCP (Teosinte branched1/Cincinnata/proliferating cell factor)家族基因是植物特有的一类转录因子,在植物生长发育的过程中具有重要的调控作用。本研究从牡丹转录组数据中鉴定出 18个TCP 基因,分子量在 18 978.32~51 789.56 Da之间,等电点在 5.81~9.45之间,TCP家族成员亚细胞定位预测均在细胞核中。牡丹 TCP结构域中保守氨基酸的分类与拟南芥相似,系统发育分析结果表明,牡丹 TCP蛋白分为两大类,ClassⅠ包含 10个 TCP成员,ClassⅡ包含 8个 TCP成员。MEME分析结果显示,在牡丹 TCP蛋白中发现了15个保守结构域,其中 motif 1为 TCP结构域,在所有 TCP成员中都存在。同时,对牡丹TCP 基因在芽、叶、花瓣、花斑、雄蕊、雌蕊和种子 7个组织中的转录水平进行了分析。本研究对牡丹 TCP家族基因进行了系统的分析,为进一步开展牡丹功能基因研究及分子育种提供了科学依据。
关键词
牡丹;TCP家族基因;TCP结构域