郑李婷¹ , 于旭东¹ , 蔡泽坪^1* , 罗佳佳^2,3 , 吴繁花⁴ , 董俊娜¹ , 谢柳青³

1 海南大学林学院, 热带特色林木花卉遗传与种质创新教育部重点实验室, 海口, 570228; 2 海南大学热带作物学院, 海口, 570228; 3 中国热带农业科学院热带作物品种资源研究所, 农业部热带作物种质资源利用重点开放实验室, 儋州, 571737; 4 海南大学生命科学与药学院, 海口,570228
作者    通讯作者
《分子植物育种》印刷版, 2020 年, 第 18卷, 第 11 篇   
收稿日期: 2020年05月26日    接受日期: 2020年05月28日    发表日期: 2020年12月10日

这是一篇采用Creative Commons Attribution License进行授权的开放取阅论文。只要对本原作有恰当的引用，版权所有人允许和同意第三方无条件的使用与传播。

为研究波罗蜜叶绿素缺失突变体(chlorophyll deficient mutant, CDM)次生生长茎中抗病基因(plant resistant genes, PRGs)的变化，从转录组数据中筛选出9 630个PRGs。去除低丰度(FPKM≤0.5)后进行差异表达基因(differentially expressed genes, DEGs)筛选，将2 513个DEGs进行加权基因共表达网络分析(weighted gene coexpression network analysis, WGCNA)，寻找到2个与表型关联性较高的模块，共183个DEGs。对模块基因进行GO功能注释、分类、转录因子(transcription factors, TFs)及类受体蛋白激酶(receptor-like kinases, RLKs)分析。结果显示，模块基因主要注释在结合(Binding)、催化活性(Catalytic activity)和代谢过程(Metabolic process)等功能组。TFs分析显示，共有7个家族，14个转录因子。RLKs分析发现，RLK-Pelle-DLSV亚家族的12个DEGs中有11个在CDM中上调表达，说明该亚家族在波罗蜜CDM次生生长茎抵御逆境侵害过程中发挥着重要作用。本研究运用转录组测序数据分析波罗蜜CDM次生生长茎中PRGs的变化，为光合作用对木本植物茎响应逆境胁迫的研究提供数据。

波罗蜜(Artocarpus heterophyllus)；叶绿素缺失突变体；次生生长茎；抗病基因