1 海南大学林学院, 热带特色林木花卉遗传与种质创新教育部重点实验室, 海口, 570228; 2 海南大学热带作物学院, 海口, 570228; 3 中国热带农业科学院热带作物品种资源研究所, 农业部热带作物种质资源利用重点开放实验室, 儋州, 571737; 4 海南大学生命科学与药学院, 海口,570228
作者
通讯作者
《分子植物育种》印刷版, 2020 年, 第 18卷, 第 11 篇
收稿日期: 2020年05月26日 接受日期: 2020年05月28日 发表日期: 2020年12月10日
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《分子植物育种》印刷版, 2020 年, 第 18卷, 第 11 篇
收稿日期: 2020年05月26日 接受日期: 2020年05月28日 发表日期: 2020年12月10日
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摘 要
为研究波罗蜜叶绿素缺失突变体(chlorophyll deficient mutant, CDM)次生生长茎中抗病基因(plant resistant genes, PRGs)的变化,从转录组数据中筛选出9 630个PRGs。去除低丰度(FPKM≤0.5)后进行差异表达基因(differentially expressed genes, DEGs)筛选,将2 513个DEGs进行加权基因共表达网络分析(weighted gene coexpression network analysis, WGCNA),寻找到2个与表型关联性较高的模块,共183个DEGs。对模块基因进行GO功能注释、分类、转录因子(transcription factors, TFs)及类受体蛋白激酶(receptor-like kinases, RLKs)分析。结果显示,模块基因主要注释在结合(Binding)、催化活性(Catalytic activity)和代谢过程(Metabolic process)等功能组。TFs分析显示,共有7个家族,14个转录因子。RLKs分析发现,RLK-Pelle-DLSV亚家族的12个DEGs中有11个在CDM中上调表达,说明该亚家族在波罗蜜CDM次生生长茎抵御逆境侵害过程中发挥着重要作用。本研究运用转录组测序数据分析波罗蜜CDM次生生长茎中PRGs的变化,为光合作用对木本植物茎响应逆境胁迫的研究提供数据。
关键词
波罗蜜(Artocarpus heterophyllus);叶绿素缺失突变体;次生生长茎;抗病基因