蒋翼杰 , 江美彦 , 姚菲 , 黄文娟 , 陈晨 , 吴卫^*

四川农业大学农学院, 成都, 611130
作者    通讯作者
《分子植物育种》印刷版, 2021 年, 第 19卷, 第 11 篇   
收稿日期: 2020年05月05日    接受日期: 2020年05月08日    发表日期: 2021年08月08日

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CONSTANS-like 是植物中重要的开花调控基因家族。基于川白芷全长转录组数据库，利用 Pfam、CELLO v.2.5、MEME、iTOL、SOPMA 在线工具和 Bioedit、MEGA 7.0、DNAMAN 6.0、TBtool、Modeller 和 Pymol软件分析川白芷 CONSTANS-like 家族蛋白的理化性质，亚细胞定位，保守结构域，系统进化，二级结构和同源建模等。通过荧光定量分析筛选具有潜在调控功能的候选基因。结果表明，筛选到 12 个具有完整结构的川白芷 COSNTANS-like (AdCOL)基因。其中 AdCOL2 为稳定性疏水性蛋白，其他均为不稳定性疏水蛋白，定位在细胞核，具有保守的 CCT 结构域，但 N 端 B-BOX 锌指结构的序列差异较大。12 个 AdCONSTANS-like 家族蛋白质被分为三类，该家族部分成员与大豆和拟南芥亲缘关系较近。AdCONSTANS-like 蛋白质三级结构主要在无规则卷曲长度和 α- 螺旋数量上存在差异。5 个 AdCONSTANS-like 基因在川白芷早抽薹植株叶片中的相对表达量显著低于正常植株叶片中的表达量。对川白芷 CONSTANS-like 蛋白家族的系统分析为其功能深入研究提供了一定理论依据。

川白芷(Angelica dahurica var. formosana)；川白芷 CONSTANS-like 家族(AdCOL)；生物信息学