兰俊¹ , 蒋维昕² , 张磊¹ , 梁馨元² , 白天道^2*

1广西壮族自治区国有东门林场,崇左, 532108; 2广西大学林学院,南宁, 530000
作者    通讯作者
《分子植物育种》印刷版, 2021 年, 第 19卷, 第 14 篇   
收稿日期: 2020年05月03日    接受日期: 2020年05月08日    发表日期: 2021年12月12日

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为了获得珍贵用材树种大花序桉顶芽转录组数据及预测关键基因功能，本研究基于 Illumina HiSeq X Ten测序技术获得大花序桉顶芽转录组原始数据，经 Trinity组装拼接获得高质量 Unigene，并与NR、Swiss-Prot、GO、KOG、eggNOG和 KEGG等生物信息数据库进行序列比对和功能注释，利用 MISA软件进行 SSR位点搜索和分析。从大花序桉顶芽中共获得 26 587条高质量 Unigene，平均长度为 1 279.69 bp；共有 22 099条 Unigene至少在一个数据库中被成功注释，其中，11 507条 Unigene被注释到 KOG数据库中 25个功能类别，以参与一般功能基因的数量最多；GO数据库中，所注释到的 14 105条 Unigene分别匹配到生物功能、细胞组分和分子功能 3大类 50个功能基因区，其中执行生物过程所占比例最多；KEGG功能注释共发现有 7 117个 Unigene参与 127条代谢通路，以代谢相关的基因最丰富；共有 1 021条 Unigene注释到转录因子数据库，分布于 65个家族，其中比例最大的是 bHLH和 MYB家族；3 274条 Unigene注释到植物抗性基因数据库，分布于 13个类别，相匹配基因数量最大的是 RLP和 TNL。MISA软件共检测到12 366个 SSR位点，分布密度为 1/2.75 kb，重复基元类型丰富，标记开发潜力大。本研究利用高通量测序获得丰富的顶芽转录组信息，可以为大花序桉分子辅助育种提供丰富的资源。

大花序桉；Illumina HiSeq X Ten；转录组；基因注释；顶芽