李星磊 , 邢宏堃 , 严菊 , 王功伟

华中农业大学作物遗传改良国家重点实验室, 武汉, 430070
作者    通讯作者
《分子植物育种》印刷版, 2015 年, 第 13卷, 第 7 篇   doi: 10.13271/j.mpb.013.000066
收稿日期: 2014年04月21日    接受日期: 2014年06月20日    发表日期: 2014年07月04日

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nyc3基因在叶绿素降解过程中起关键作用。本研究通过分析nyc3基因在533份水稻核心种质材料中存在的自然变异，发现了nyc3基因序列具有非常丰富的单核苷酸多态性，并在基因的转录区域共找到了28个SNPs，其中在启动子区域检测到10个SNPs，在5'UTR检测到2个SNPs，在3'UTR检测到16个SNPs。利用生物信息学软件，将核心种质中nyc3分为14个单倍型，筛选其中6个主要单倍型进行染色体画图，明确了各单倍型之间存在的SNP差异，同时确定28个SNPs在基因转录区域的分布。通过实验室构建的全基因组范围内水稻全生育期表达谱数据库，找到在不同时期、不同组织中nyc3的表达量，通过分析可以发现，nyc3的表达量伴随着水稻的生长在不断的升高，在水稻成熟期，叶片中nyc3的表达量达到最高值，充分说明nyc3在调控叶绿素降解上起到作用。

水稻；Oryza sativa L.； nyc3基因；单倍型；表达量；叶绿素降解