江建霞¹ , 李延莉¹ , 蒋美艳¹ , 朱吉风¹ , 周熙荣¹ , 王伟荣¹ , 沈淳² , 张俊英^1* , 杨立勇^1*

1上海市农业科学院作物育种栽培研究所,上海, 201403; 2上海市青浦区农业技术推广服务中心,上海, 201700
作者    通讯作者
《分子植物育种》印刷版, 2021 年, 第 19卷, 第 2 篇   
收稿日期: 2020年04月20日    接受日期: 2020年04月24日    发表日期: 2021年11月26日

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为定位白菜型油菜开花时间相关的候选基因，为白菜型油菜抽薹和开花时间遗传改良提供依据，以110份白菜型油菜组成的自然群体为研究材料，对它们进行花期调查和重测序分析。利用重测序获得的高质量的 SNP集合对 110份材料进行群体进化树分析、主成分分析和群体遗传结构分析和全基因组关联分析。花期观察结果表明，不同地理位置的白菜型油菜在开花时间上存在广泛差异。群体结构分析结果显示，110份材料可分为 2个亚群，亚群内部分布较为集中，2个亚群之间的分布与白菜型油菜材料所处的地理位置密切相关。对开花时间进行全基因组关联分析，发现白菜型油菜全基因组衰减平均 LD为 19 kb，并获得了 4个与开花时间表型显著关联的信号位点。对 4个关联候选位点所在物理位置上下游一定区域内的相关基因进行功能注释，筛选得到白菜型油菜开花时间相关候选转录本 9个，进一步分析发现 9个转录本中一共包含4个候选基因，它们是拟南芥LOL1、CAT5 和FAD8 等的同源基因。本研究结果为获得白菜型油菜开花时间相关的候选基因，并利用候选基因进行花期调控和遗传改良提供一定理论基础和线索。

白菜型油菜(Brassica campestris)；开花时间；连锁不平衡；全基因组关联分析；候选基因