遵义师范学院生物与农业科技学院,遵义, 563006
作者 通讯作者
《分子植物育种》印刷版, 2021 年, 第 19卷, 第 11 篇
收稿日期: 2020年04月20日 接受日期: 2020年04月24日 发表日期: 2021年07月23日
作者 通讯作者
《分子植物育种》印刷版, 2021 年, 第 19卷, 第 11 篇
收稿日期: 2020年04月20日 接受日期: 2020年04月24日 发表日期: 2021年07月23日
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摘 要
钙依赖蛋白激酶(CDPKs)在调节植物生长发育与逆境胁迫响应中发挥了关键作用,研究CDPK 基因的序列信息与表达模式,为揭示蛋白结构、基因功能及参与的抗逆信号网络奠定基础。采用 RT-PCR、RACE技术获得白芨BsCDPK1 基因 cDNA全长;利用生物信息学软件分析其编码蛋白的理化特性和结构域等特征,并对 BsCDPK1进行氨基酸序列比对与系统进化树分析;采用实时荧光定量 PCR技术对BsCDPK1 基因在白芨幼苗期的表达模式进行检测分析。结果表明,克隆获得的BsCDPK1 基因 cDNA全长为 1 981 bp,编码496个氨基酸,其编码蛋白相对分子质量为 55.997 kD,理论等电点 5.38,脂肪指数为 87.50,不稳定指数为43.54。BsCDPK1蛋白包含 CDPKs家族典型的激酶结构域、自抑制功能域、ATP结合位点以及 C- 端的 4个EF-hand手性结构,并且高度保守;BsCDPK1与铁皮石斛、蝴蝶兰的CDPK 基因亲缘关系最近,聚为一支。qRT-PCR结果表明BsCDPK1 在白芨幼苗的根、茎、叶中均有表达。白芨BsCDPK1 基因的克隆与序列特征分析、幼苗组织表达模式分析为阐明BsCDPK1 基因在白芨生长发育和逆境胁迫中的功能奠定实验基础。
关键词
白芨(Bletilla striata);钙依赖蛋白激酶;基因克隆;表达分析