王超霞^1* , 商佳胤^1* , 李凯¹ , 集贤² , 张鹤¹ , 张娜¹ , 王丹¹ , 苏宏¹ , 田淑芬³

1 天津市农业科学院果树研究所, 天津, 300384; 2 天津市农业科学院农产品保鲜与加工技术研究所, 天津, 300384; 3 天津农学院园艺园林学院,天津, 300380
作者    通讯作者
《分子植物育种》印刷版, 2021 年, 第 19卷, 第 9 篇   
收稿日期: 2020年04月01日    接受日期: 2020年04月06日    发表日期: 2021年09月25日

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为探究夏黑葡萄叶片衰老相关基因的表达情况及代谢通路，本研究以叶果比 12:1 修剪的夏黑葡萄为材料，采用高通量测序技术对采集花后 45、65、85 和 105 d 的叶片进行转录组分析。结果显示，花后 45 d的样品中得到 50 855 290 条 clean reads，GC 含量为 46.49%；花后 65 d 的样品中得到 50 432 588 条 clean reads，GC 含量为 46.13%；花后 85 d 的样品中得到 52 169 372 条 clean reads，GC 含量为 47.10%；花后 105 d的样品中得到 50 988 842 条 clean reads，GC 含量为 47.01%。与参考基因组进行序列比对，发现各样品74.20%以上的 reads 比对到参考基因组，绝大部分分布在外显子区，其中有 72.43%的 reads 比对到参考基因组的唯一位置。各样品间基因差异表达分析得到共有差异基因 2 583 个。GO 功能注释分析发现这些差异基因主要参与生物过程中的光合作用，以及与核酸结合转录因子活性等分子功能相关；SNP 位点分析结果发现在每个样品中平均有 417 490 个变异位点，主要分布在外显子区、内含子区、基因上下游区域。本研究明确了夏黑葡萄叶片衰老过程中相关基因的变化，为进一步挖掘夏黑葡萄叶片衰老过程中关键基因的功能奠定了理论基础。

夏黑葡萄；高通量测序技术；叶片衰老；转录组