研究报告

玉米粒宽的全基因组关联分析及候选基因结构预测  

高嵩1* , 刘宏伟1* , 周旭东1* , 周德龙1 , 吕庆雪1 , 赵兴彦2 , 仲义1 , 夏远峰1** , 宋广树1**
1 吉林省农业科学院, 长春, 130033; 2 辽源市农业科学院, 辽源, 136200
作者    通讯作者
《分子植物育种》印刷版, 2021 年, 第 19卷, 第 4 篇   
收稿日期: 2020年03月24日    接受日期: 2020年03月27日    发表日期: 2021年08月08日
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摘 要

粒宽与产量有显著正相关性,为了筛选与玉米粒宽紧密关联的 SNP 位点和控制粒宽的相关的候选基因,本实验采用全基因组关联分析的方法,以 139 份核心玉米自交系为关联群体,对其粒宽进行考种测量。同时利用 6 973 个高质量的 SNP 标记,结合表型数据进行全基因组关联分析。关联分析结果共检测到 21 个与玉米粒宽显著性相关的 SNP 位点,在 LD 衰退有效距离上下 20 kb 范围内挖掘到 2 个候选基因,与前人报道的完全一致,分别是主要编码叶绿体中钠代谢物共转运体 BASS4 (GRMZM2G092475)、含 SWIB 复合BAF60b 结构域的蛋白(GRMZM2G124502)。本研究为进一步了解粒宽的遗传结构和研发高产品种具有一定的理论基础。

关键词
玉米粒宽;全基因组关联分析;SNP 标记
《分子植物育种》印刷版
• 第 19 卷
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