和亚男^* , 李稳^* , 尹俊雅 , 谢先芝^**

山东省水稻研究所, 济南, 250100
作者    通讯作者
《分子植物育种》印刷版, 2021 年, 第 19卷, 第 1 篇   
收稿日期: 2020年03月06日    接受日期: 2020年03月13日    发表日期: 2021年05月06日

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干扰素相关发育调节因子(interferon-related developmental regulator factor, IFRD)在动物中有较深入研究，参与动物细胞发育和分化及多种疾病的发生，但是在植物中研究较少。为了挖掘植物 IFRD 基因的功能，本研究对禾本科模式作物水稻 IFRD 基因家族成员进行了系统的生物信息学分析。本研究鉴定得到 5 个水稻 IFRD 基因家族成员，分布在 4 条染色体上，根据进化树把它们分为 2 个亚家族，不同亚家族成员具有不同的基因组结构、蛋白质保守基序和表达模式。高温、盐胁迫处理后的转录组测序分析结果显示，该基因家族成员(OsIFRD3, OsIFRD4)对逆境的响应变化差异显著；蛋白质相互作用分析结果显示水稻 IFRDs 可能与 mRNA 可变剪接因子、甲硫氨酰 tRNA 合成酶、rRNA 加工蛋白相互作用；启动子分析显示水稻 IFRD 启动子具有非生物胁迫和植物激素响应元件。综上表明水稻 IFRD 基因家族可能通过调控 mRNA 可变剪接和蛋白质的合成参与高温、盐胁迫逆境响应途径。本研究为深入解析水稻 IFRD 基因功能提供了重要信息。

水稻；IFRD；基因家族；生物信息学分析