朱阅^1,2 , 郭亚静² , 冯程² , 潘帮珍² , 何惠英² , 徐增富² , 杜光辉^1* , 付乾堂^2*

1云南大学农学院,昆明, 650500; 2中国科学院西双版纳热带植物园,种子创新研究院,中国科学院热带植物资源可持续利用重点实验室,勐腊, 666303
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《分子植物育种》印刷版, 2021 年, 第 19卷, 第 23 篇   
收稿日期: 2020年03月04日    接受日期: 2020年03月09日    发表日期: 2021年06月27日

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基于星油藤(Plukenetia volubilis L.)转录组信息，分析其表达序列标签 - 简单序列重复(expressed sequence tag-simple sequence repeat, EST-SSR)并设计引物进行验证，为星油藤的 SSR分子标记开发提供数据支持。本研究利用 MISA软件对星油藤雌雄花序芽转录组测序所获得的 57 664条 Unigenes进行分析，共检测出 10 572个 SSR位点；其中 8 825条 Unigenes分布有 SSR位点，占总 Unigenes的 15.30%。SSR位点的平均分布频率为每 5.34 kb出现 1个 SSR位点。各类型的 SSR位点共有 154种，其中单核苷酸重复(40.48%)、二核苷酸重复(25.82%)和三核苷酸重复(28.89%)为主要的重复类型，A/T、AG/TC和 AAG/CTT分别为单核苷酸、二核苷酸和三核苷酸类型中主导的重复基序。利用 Primer 3.0设计 EST-SSR引物，并随机挑选 75对 SSR引物，以星油藤及其 2个近缘种(亚洲星油藤和大果星油藤)为材料进行筛选验证，其中 31对引物可进行有效扩增，并最终获得 7对在 3个物种间具有多态性的引物。本研究结果表明，星油藤转录组测序产生的 Unigenes序列信息作为开发 SSR分子标记是可行的，开发的这些 SSR分子标记可用于星油藤及其近缘种的遗传多样性评价、种质资源鉴定和分子标记辅助育种等研究。
 

星油藤；亚洲星油藤；大果星油藤；转录组；EST-SSR