研究报告/Research Report

甘蓝型油菜PGIP基因家族新成员PGIP18的克隆及序列分析  

彭琦1 , 陈松1 , 张维1 , 伍林涛2 , 周晓婴1 , 高建芹1 , 张洁夫1 , 戚存扣1
1 国家油菜改良中心南京分中心, 农业部长江下游棉花与油菜重点实验室, 江苏省农业科学院经济作物研究所, 南京, 210014;
2 贵州禾睦福种子有限公司, 贵阳, 550008
作者    通讯作者
《分子植物育种》印刷版, 2014 年, 第 12卷, 第 8 篇   doi: 10.13271/j.mpb.012.000687
收稿日期: 2014年03月26日    接受日期: 2014年06月21日    发表日期: 2014年07月01日
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推荐引用:

Peng Q., Chen S., Zhang W., Wu L.T., Zhou X.Y., Gao J.Q., Zhang J.F., and Qi C.K., 2014, Cloning and bioinformatics analysis of new PGIP gene (PGIP18) in Brassica napus L., Fenzi Zhiwu Yuzhong (Molecular Plant Breeding), 12(4): 687-693 (彭琦, 陈松, 张维, 伍林涛, 周晓婴, 高建芹, 张洁夫, 戚存扣, 2014, 甘蓝型油菜PGIP基因家族新成员PGIP18的克隆及序列分析, 分子植物育种, 12(4): 687-693)

摘 要

菌核病是油菜的主要病害之一,目前尚未在油菜及相关植物中找到抗性基因。油菜等植物中的PGIP蛋白对核盘菌的致病因子PG具有诱导性防卫反应作用,有关PGIP蛋白的防卫反应机制研究已成为热点。本研究利用同源序列法,从甘蓝型油菜宁RS-1中克隆得到1个尚未报道的PGIP基因家族新成员——PGIP18。通过生物信息学分析发现,该基因的DNA具有1段长97 bp的内含子序列和两段外显子序列,编码的氨基酸序列与甘蓝型油菜PGIP2亚家族蛋白同源性较高,且都由保守的N端信号肽和富含亮氨酸的LRR重复结构域组成。该基因的克隆为揭示油菜中内源PGIP基因的抗病机制和功能研究提供了新的基因资源。

关键词
甘蓝型油菜;PGIP家族;PGIP18;克隆;生物信息学分析
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《分子植物育种》印刷版
• 第 12 卷
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