新疆农业大学农学院,棉花教育部工程研究中心,农业生物技术重点实验室,乌鲁木齐, 830052
作者 通讯作者
《分子植物育种》印刷版, 2021 年, 第 19卷, 第 8 篇
收稿日期: 2020年02月16日 接受日期: 2020年02月21日 发表日期: 2021年06月02日
作者 通讯作者
《分子植物育种》印刷版, 2021 年, 第 19卷, 第 8 篇
收稿日期: 2020年02月16日 接受日期: 2020年02月21日 发表日期: 2021年06月02日
© 2021 BioPublisher 生命科学中文期刊出版平台
这是一篇采用Creative Commons Attribution License进行授权的开放取阅论文。只要对本原作有恰当的引用,版权所有人允许和同意第三方无条件的使用与传播。
摘 要
为了挖掘鉴定棉纤维发育相关基因,本研究根据海岛棉 RIL群体定位的纤维强度 QTL位点,结合转录组数据及海岛棉全基因组数据库注释信息,筛选出 1个 R2R3类 MYB转录因子基因 Gbar_A11G032760.1,根据该基因的注释信息,克隆并命名该基因为GbMYB5,qRT-PCR分析发现,在纤维发育15、20、25 DPA (Days post anthesis),该基因在高 FS (Fiber strength)材料中的表达量显著高于低 FS材料,且在高 FS材料中明显上调表达;氨基酸序列分析表明,GbMYB5 基因的编码区长 747 bp,编码 248个氨基酸残基,氨基酸序列包含 1个高度保守的 HTH-myb DNA-binding domain;序列同源比较及系统发育进化表明,该基因与不同物种的 MYB5相关蛋白氨基酸序列都存在 1个高度保守的 HTH结构域;GbMYB5和雷蒙德氏棉的 MYB5聚集在同一分支上,该基因与雷蒙德氏棉的同类基因亲缘关系较近。利用 qRT-PCR分析不同组织表达情况,发现GbMYB5 基因在花瓣和花萼中极显著表达量,雌蕊和雄蕊中显著表达一般,茎组织中表达不显著。研究初步分析了该基因的氨基酸序列及表达模式,为今后棉花 MYB转录因子在纤维发育阶段的功能及分子机制的研究提供依据。
关键词
海岛棉(Gossypium barbadense);纤维;GbMYB5;克隆;表达分析