1 河北农业大学林学院, 保定, 071001; 2 河北农业大学园艺学院, 保定, 071001; 3 河北农业大学生命科学学院, 保定, 071001; 4 北京林果业生态环境功能提升协同创新中心, 北京, 100000
作者
通讯作者
《分子植物育种》印刷版, 2021 年, 第 19卷, 第 16 篇
收稿日期: 2020年02月11日 接受日期: 2020年02月14日 发表日期: 2021年05月11日
![](https://molplantbreed.org/templates/images/email1.bmp)
![](https://molplantbreed.org/templates/images/email2.bmp)
《分子植物育种》印刷版, 2021 年, 第 19卷, 第 16 篇
收稿日期: 2020年02月11日 接受日期: 2020年02月14日 发表日期: 2021年05月11日
© 2021 BioPublisher 生命科学中文期刊出版平台
这是一篇采用Creative Commons Attribution License进行授权的开放取阅论文。只要对本原作有恰当的引用,版权所有人允许和同意第三方无条件的使用与传播。
摘 要
OVATE 基因家族编码一类广泛存在于植物体内的转录抑制因子,但枣中 OVATE 基因家族研究未见报道。本研究基于枣全基因组数据鉴定到枣 OVATE 基因家族 15 个基因,并对其进行生物信息学分析,发现 15 个基因非均匀地分布在 8 条染色体上,各基因长度相差较大,除了 ZjOFP3 以外,均不含有内含子结构。各基因共有 motif 1 保守基序,除 ZjOFP15 以外都含有 motif 1、motif 2 和 motif 3 保守基序且顺序相同。系统进化研究发现枣、桃和苹果等 6 个物种的 OVATE 基因家族的 119 条蛋白序列可以分为 4 个类群,而枣OVATE 基因家族分布在各个类群中,进化过程中相对保守。枣 OVATE 蛋白分别定位细胞外、线粒体、质膜及细胞核上,反映出 OVATE 基因家族功能的多样性。此外,除了 ZjOFP3、ZjOFP9 和 ZjOFP15 以外,其余皆有着相似的三级结构。顺式作用元件预测发现枣 OVATE 基因家族与光响应、逆境胁迫、激素诱导、生长发育有关。本研究可为枣 OVATE 基因家族进一步研究提供参考。
关键词
枣;OVATE 基因家族;生物信息学