肖雨沙 , 陈秀清 , 李红春 , 王凯俐 , 宋莉英^*

广州大学生命科学学院, 广州, 510006
作者    通讯作者
《分子植物育种》印刷版, 2021 年, 第 19卷, 第 26 篇   
收稿日期: 2020年02月09日    接受日期: 2020年02月14日    发表日期: 2021年05月12日

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南美蟛蜞菊(Wedelia trilobata)是华南地区危害严重的入侵植物，对其遗传多样性的研究仅局限于ISSR 分子标记。本研究利用 MISA 软件对南美蟛蜞菊转录组测序获得的 88 504 条 Unigene 进行了 SSR 位点及特征分析，结果发现 SSR 位点 23 338 个，SSR 出现频率为 26.37%，发生频率为 21.07%，平均距离为1 224.61 kb。其中单核苷酸重复所占比例最高，占总 SSR 位点的 46.92%。二核苷酸重复类型和三核苷酸重复类型分别占 26.66%和 24.55%。本研究对南美蟛蜞菊转录组测序得到的 23 338 个 SSR 位点使用 Primer 3 软件进行引物设计，随机选择了 200 对引物进行了扩增实验验证，有效扩增 55 对，其中 6 对引物特异性高，重复性好。平均 Shannon's 多样性信息指数(I)和多态性信息含量(PIC)分别为 0.760 和 0.511，表明其具有较高的多态性。本研究结果为今后开展南美蟛蜞菊遗传多样性方面的研究提供了实验基础。

南美蟛蜞菊；转录组；SSR；遗传多样性