研究报告

水稻抗稻瘟病基因 Bsr-d1 的 SNP 区域在地方品种中的变异分析  

刘畅媛1,2 , 孙一丁2 , 马继琼2 , 杨奕2 , 汤翠凤2 , 阿新祥2 , 郭怡卿1 , 许明辉2*
1 云南农业大学植保学院, 昆明, 650201; 2 云南省农业科学院生物技术与种质资源研究所, 云南省农业生物技术重点实验室, 农业农村部西南作物基因资源与种质创制重点实验室, 昆明, 650205
作者    通讯作者
《分子植物育种》印刷版, 2021 年, 第 19卷, 第 2 篇   
收稿日期: 2020年01月14日    接受日期: 2020年01月17日    发表日期: 2021年05月06日
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摘 要

为揭示地方水稻品种中稻瘟病持久抗性基因 Bsr-d1 序列变异类型,本研究以收集到的缅甸、老挝和越南共 79 份地方水稻品种为供试材料,设计抗稻瘟病 Bsr-d1 基因特异引物对 Bsr-d1 基因启动子功能位点区段进行 PCR 扩增及测序分析。研究表明,79 份地方水稻均持有抗稻瘟病 Bsr-d1 bsr-d1 等位基因,品种间存在 18 个变异位点和 22 个碱基的差异,根据差异所有品种可归为 6 种单倍型,其中 H4 H6 为优势单倍型,分别占测试品种的 20.25%58.23%6 种单倍型中仅 H3 单倍型携带抗性位点,有 8 个材料归为此类型,占 10.13%。缅甸地方品种拥有 H1 (15.79%)H2 (2.63%)H3 (13 .16%)H4 (18.42%)H6 (50%)5 种单倍型,优势单倍型为 H6;老挝地方品种有 H1 (2.56%)H3 (7.69%)H4 (23.08%)H5 (2.56%)H6 (64.10%) 5种单倍型,H6 为优势单倍型,表明缅甸、老挝间在单倍型种类和抗性品种比例上均存在一定差异。本研究结果表明缅甸、老挝水稻资源携带持久抗性基因 Bsr-d1 的品种比例远高于中国品种,对中国选育稻瘟病持久抗性品种具有重要的利用价值,应加强对该地区种质的引进和分析评价。

关键词
水稻;种质资源;稻瘟病;抗性基因;单倍型
《分子植物育种》印刷版
• 第 19 卷
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