1 吉林省农业科学院作物资源研究所, 公主岭, 136100; 2 延边大学农学院, 延吉, 133002; 3 公主岭市气象局, 公主岭, 136100
作者 通讯作者
《分子植物育种》印刷版, 2021 年, 第 19卷, 第 38 篇
收稿日期: 2020年01月12日 接受日期: 2020年01月17日 发表日期: 2021年05月13日
作者 通讯作者
《分子植物育种》印刷版, 2021 年, 第 19卷, 第 38 篇
收稿日期: 2020年01月12日 接受日期: 2020年01月17日 发表日期: 2021年05月13日
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摘 要
本研究以 95 份玉米自交系为试材,测定 10 ℃低温下种子的发芽率、发芽指数、平均发芽时间以及其相对值等 6 个性状,采用主成分分析、聚类分析等统计方法对自交系萌发期耐冷性进行鉴评,筛选耐冷种质;基于 55K 芯片数据,揭示 95 份自交系的群体结构,并探讨杂优类群与萌发期耐冷性的关系;采用混合线性模型(mrMLM)进行全基因组关联分析(GWAS),检测与耐冷性状显著关联的 SNP (Single nucleotide polymorphism)位点。结果表明,主成分分析将 6 个单项指标综合为 2 个独立的综合指标,系统聚类将自交系划分为 5 类,耐冷性强、较强、中等、较弱、弱的材料分别为 11、25、26、15、18 份。95 份自交系被划分为‘瑞德’、‘旅大红骨’、‘兰卡斯特’、‘四平头’、‘PB’与混合群等 6 个类群,其中本土种质‘四平头’与‘旅大红骨’的整体耐冷性高于其它类群,可选择国内种质伊国外种质的杂优模式进行耐冷种质改良。基于 GWAS 结果,共检测到26 个与耐冷性状显著相关的 SNP 位点,单个 SNP 解释的表型变异为 2.16%~32.63%。本研究为优异基因的克隆、有效功能标记的开发以及后续的种质改良与创新提供了种质资源、技术基础和理论依据。
关键词
玉米(Zea mays L.);萌发期;耐冷性;鉴评;全基因组关联分析