研究报告

大白菜叶柄黑点症抗性相关候选基因的挖掘  

雷娟利 , 岳智臣 , 陶鹏 , 赵彦婷 , 李必元*
浙江省农业科学院蔬菜研究所,杭州, 310021
作者    通讯作者
《分子植物育种》印刷版, 2021 年, 第 19卷, 第 23 篇   
收稿日期: 2020年01月03日    接受日期: 2020年01月10日    发表日期: 2021年04月12日
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摘 要

大白菜叶柄黑点症是严重影响大白菜商品性的一种生理性病害。本研究以抗大白菜叶柄黑点症品系(韩春娃 C8-1)和感叶柄黑点症品系(韩春娃 -4-2-3-4)为亲本,构建 F2群体,通过高 N水平水培处理,筛选出高抗叶柄黑点症和高感叶柄黑点症的植株各 20株,构建两个极端性状混池 DNA文库,通过 BSA-Seq技术,对大白菜叶柄黑点症抗性相关候选基因进行挖掘。对于 502 662个高质量的 SNP位点和 173 111个高质量的 InDel位点,利用 EDIndex方法对这些 SNPInDel位点分别进行关联分析,取所有结果的交集,得到 1个包含 295个编码基因,位于第 1染色体的候选区域,与叶柄黑点数性状紧密关联;对这 295个基因进行进一步的功能注释,NRSwiss-ProtGOKEGGCOG数据库共注释到 292个基因,其中存在 133个非同义突变基因,30个移码突变的基因。候选区域内编码基因的深度注释有助于功能基因的进一步分离,为大白菜叶柄黑点症抗性相关基因的精细定位及克隆提供理论依据。

关键词
大白菜;叶柄黑点症;抗性;候选基因
《分子植物育种》印刷版
• 第 19 卷
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