张丽芳¹ , 桂腾茸² , 代冬琴¹ , 魏晓梅¹ , 殷斯¹ , 胡海林^3*

1曲靖师范学院生物资源与食品工程学院,曲靖, 655011; 2曲靖师范学院经济与管理学院,曲靖, 655011; 3曲靖师范学院数学与统计学院,曲靖, 655011
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《分子植物育种》印刷版, 2021 年, 第 19卷, 第 5 篇   
收稿日期: 2020年01月02日    接受日期: 2020年01月10日    发表日期: 2021年04月06日

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马铃薯根结线虫病害具有侵染性、隐蔽性、突发性和流行性，一旦被感染，将造成严重损失。为进一步分析健康马铃薯与感染根结线虫马铃薯根际土壤细菌的群落结构及多样性，本研究采用高通量测序技术对根际土壤细菌 16S rRNA V3-V4区序列进行测序，应用生物信息学手段分析测序结果。结果表明，感染根结线虫的马铃薯根际土壤细菌类群 Shannon指数和 Chao1指数均比健康植株的低，Simpson指数比健康植株高，说明感病植株根际土壤中细菌群落丰富度和多样性均比未感病植株低。从门(Phylum)科(Family)属(Genus)上分析菌群丰度，可看出感病植株中主要的优势菌门为放线菌门(Actinobacteria)；优势菌科为链霉菌科(Streptomycetaceae)和微球菌科(Micrococcaceae)；主要的优势菌属为链霉菌属(Streptomyces)和节细菌属(Arthrobacter)。本研究结果为进一步研究马铃薯根际微环境菌群的多样性和平衡性，提高马铃薯产量和质量提供理论基础。

马铃薯根结线虫；根际土壤；高通量测序；细菌群落多样性