毕楚韵^1,2* , 黄小芳^1,2* , 周丽香³ , 石媛媛² , 胡韵卓⁴ , 梁才晓³ , 黄碧芳³ , 许明 ² , 林世强^1,3** , 陈选阳^1,2**

1福建农林大学,作物生物技术福建省高校重点实验室,福州, 350002; 2福建农林大学农学院,福州, 350002; 3福建农林大学生命科学学院,福州, 350002; 4福建农林大学植物保护学院,福州, 350002
作者    通讯作者
《分子植物育种》印刷版, 2021 年, 第 19卷, 第 5 篇   
收稿日期: 2020年01月01日    接受日期: 2020年01月06日    发表日期: 2021年06月26日

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植物抗病 R基因在植物抵抗细菌、病毒、真菌等病原体过程中发挥重要作用，NBS-LRR类基因是 R基因中最大的一类。三浅裂野牵牛作为甘薯的近缘野生种，是甘薯育种重要的抗病基因资源。本研究对三浅裂野牵牛基因组序列使用 Snap软件预测全基因组蛋白质序列，应用生物信息学方法在蛋白质序列中鉴定和分析 NBS-LRR家族基因，得到三浅裂野牵牛 NBS-LRR家族基因的数量、染色体上的分布图、结构域特点和进化树。从三浅裂野牵牛的 110 626个基因中，筛选到 361个编码 NBS-LRR类蛋白的基因，其中 N型50个，NL型 128个，TNL型 46个，CNL型 136个，RNL型 1个。三浅裂野牵牛的 15条染色体上均分布有NBS-LRR家族基因，基因最多的染色体有 51个，最少的有 2个，共有 58个基因簇，包含了 53.7%的NBS-LRR家族基因。CNL亚家族在 NB-ARC结构域有 7个保守结构域，TNL亚家族有 10个保守结构域。本研究对三浅裂野牵牛的 NBS-LRR家族基因的鉴定与分析，为后续研究抗病基因功能与甘薯抗病的分子育种提供重要参考。
 

三浅裂野牵牛；NBS-LRR；R基因；基因家族；生物信息学