研究报告

全基因组鉴定和表达模式分析玉米 AP2转录因子  

郭海滨 , 郝立冬* , 魏雅冬
绥化学院农业与水利工程学院,绥化, 152061
作者    通讯作者
《分子植物育种》印刷版, 2021 年, 第 19卷, 第 2 篇   
收稿日期: 2019年12月30日    接受日期: 2020年01月03日    发表日期: 2021年04月06日
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摘 要

AP2属于 AP2/ERF转录因子家族中的一个亚族,其主要特征是具有 2个独立的 AP2/ERF结构域。本研究利用生物信息学的方法在玉米基因组中鉴定到 22个玉米 AP2转录因子,并对其理化性质、基因结构、保守基序、系统进化关系和表达模式进行了分析。结果表明,玉米 AP2家族成员的理化性质差异较大,且都属于亲水性蛋白。系统进化分析表明玉米 AP2家族基因被分为 euANTbaselANTeuAP2三个亚组,相同亚组的基因具有相似的基因结构和保守基序。共线性分析发现玉米 AP2家族基因中不存在基因串联重复事件,只存在两对片段复制事件,同时结果表明禾本科 AP2家族基因之间具有很好的共线性关系。表达模式分析发现ZmAP2 基因广泛参与植物的生长发育。转录组数据分析发现,在盐胁迫下一共鉴定到 16ZmAP2基因。本研究为进一步研究玉米 AP2转录因子家族的生物学功能提供了科学依据。

关键词
AP2;玉米;盐胁迫;转录因子;表达分析
《分子植物育种》印刷版
• 第 19 卷
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