苗立祥 , 杨肖芳 , 张豫超 , 沈颖越 , 李小白 , 蒋桂华^*

浙江省农业科学院园艺研究所, 杭州, 310021
作者    通讯作者
《分子植物育种》印刷版, 2021 年, 第 19卷, 第 21 篇   
收稿日期: 2019年12月27日    接受日期: 2020年01月07日    发表日期: 2021年03月23日

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基于基因组序列信息，研究了二倍体森林草莓和八倍体栽培草莓染色体上SSR位点的分布特点。利用AutoSSR软件在森林草莓和栽培草莓中分别发掘到153826个和329801个SSR位点，发生频率分别为1.43 kb/SSR和2.44 kb/SSR。SSR重复基序为单核苷酸的数量最多，分别占总数的40.92%和38.94%，其次为二核苷酸类型，分别占22.79%和20.04%。在二倍体草莓和八倍体草莓中分别鉴定到454和479种SSR重复类型，其中A/T重复类型的SSR出现的频率最高，分别占总SSR位点的39.45%和37.08%。二核苷酸重复类型中，二倍体草莓的AT/AT占比最高，为11.61%，其次为AG/CT（8.74%）；八倍体草莓中AG/CT重复类型占比最高（9.94%），其次为AT/AT（7.35%）。用Beacon Designer软件设计SSR引物，随机挑选了59对SSR引物在77份草莓材料中进行验证分析。结果显示，59对SSR共扩增出254个多态性位点，平均每对引物可扩增4.31个位点，位点的平均多态信息量（PIC）为0.26，介于0.07 ~ 0.97之间，其中35个SSR位点PIC≥0.50，为高多态性位点，聚类分析显示品种间的相似系数范围为0.47~0.99。该研究为草莓种质资源的遗传多样性评价、变异分析、分子标记辅助育种等工作提供了技术支持。

森林草莓； 栽培草莓； 基因组；SSR