研究报告

枣裂果相关的基因筛选  

王建宇 , 高秋玲 , 张晶晶 , 王振磊 , 林敏娟*
塔里木大学植物科学学院, 南疆特色果树高效优质栽培与深加工技术国家地方联合工程实验室, 新疆生产建设兵团南疆特色果树生产工程实验室, 新疆生产建设兵团塔里木盆地生物资源保护与利用重点实验室, 阿拉尔, 843300
作者    通讯作者
《分子植物育种》印刷版, 2021 年, 第 19卷, 第 8 篇   
收稿日期: 2019年12月13日    接受日期: 2019年12月20日    发表日期: 2021年08月16日
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摘 要

为了解枣果实开裂与基因表达的关系,并筛选出与裂果相关的基因,本研究以易裂品种‘伏脆蜜’为材料,利用 Illumina 测序平台对裂果和非裂果部位果皮进行转录组测序分析,结果表明裂果部位和非裂果部位两个样品中分别获得 10 025 10 041 个表达基因,其中 9 802 个基因在两个样品中都有表达,有 223个基因在裂果部位中特异表达,有 239 个基因在非裂果部位中特异表达;在裂果果皮部位对比非裂果果皮部位中筛选出差异表达基因 161 个,其中上调表达基因 39 个,下调表达基因 122 个。通过对基因功能和 KEGG 代谢通路上基因差异表达筛选,主要在合成木质素的通路上发现 2 个基因(gene16874 gene17086);在植物激素信号转导中,发现 1 AUX/IAA (gene26281)1 ARF (gene22744)1 SAUR (gene7576)1 JAZ(gene2607)基因;在植物病原体相互作用代谢通路中,2 CML (gene19427 gene19466)基因;在淀粉和蔗糖代谢通路中,有 1 - 淀粉酶(gene32293)基因和 1 Endoglucanase 12 (gene3673)基因。结合转录组数据分析和利用 RT-qPCR 验证,上述 10 个差异表达基因在裂果果皮中都高表达,说明这 10 个基因可能参与裂果的发生过程。
 

关键词
裂果; 果皮; 转录组;RT-qPCR
《分子植物育种》印刷版
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