研究报告

辣椒不同发育时期果实着色的转录组分析  

秦于玲 , 申龙斌 , 曹振木*
中国热带农业科学院热带作物品种资源研究所, 海口, 571101
作者    通讯作者
《分子植物育种》印刷版, 2020 年, 第 18卷, 第 6 篇   
收稿日期: 2019年12月22日    接受日期: 2020年01月03日    发表日期: 2020年09月08日
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摘 要

为研究辣椒果实不同发育时期着色的基因表达差异,探究参与或调控辣椒果实类胡萝卜素合成的基因或转录因子。本研究采用 RNA-Seq 技术对辣椒果实青果期(G)、转色期(B1, 果实表面 30%左右变色)、转色期(B2, 果实表面 50%左右变色)和成熟期(R)的辣椒果实进行了转录组测序分析。结果表明,G-vs-B1B1-vs-B2 B2-vs-R 上调和下调的差异表达基因(DEGs)分别为 924 个和 2 188 个;DEGs GO 富集分析主要集中在生物调控、应激反应、信号、代谢过程和生长等的生物过程;DEGs KEGG 富集分析主要富集在类胡萝卜素生物合成和淀粉、蔗糖代谢等信号通路,DEGs 共注释到 3 079 个转录因子,包括 AP2MYBMADS ERF 等类型,转录因子 AP2 在调控植物类胡萝卜素的生物合成方面已得到证实,但在辣椒果实着色过程中的作用还有待研究。本研究为进一步挖掘辣椒果实着色过程中的关键调控因子,解析调控类胡萝卜素生物合成提供理论基础。
 

关键词
辣椒果实;RNA-Seq;类胡萝卜素;转录因子
《分子植物育种》印刷版
• 第 18 卷
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