1 山东省烟台市农业科学研究院, 烟台, 265500; 2 烟台大学生命科学学院, 烟台, 264005; 3 北京林业大学园林学院, 北京, 100083; 4 烟台自然博物馆, 烟台, 264000
作者 通讯作者
《分子植物育种》印刷版, 2021 年, 第 19卷, 第 25 篇
收稿日期: 2019年12月19日 接受日期: 2019年12月25日 发表日期: 2021年03月14日
作者 通讯作者
《分子植物育种》印刷版, 2021 年, 第 19卷, 第 25 篇
收稿日期: 2019年12月19日 接受日期: 2019年12月25日 发表日期: 2021年03月14日
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摘 要
为探明蝴蝶兰花芽分化调控的内在分子机制,探明花芽分化过程中的关键基因,本研究以蝴蝶兰不同分化时期的花芽进行转录组测序,筛选调控植株成花转变的关键基因并进行实时荧光定量PCR(qRT-PCR)验证。测序共得到44.42Gb的原始数据,分别注释到7个公共数据库(Swiss-Prot、Nr、KEGG、KOG、Pfam、eggNOG和 GO)。其中成功被GO注释到的unigenes有16181条;被KEGG注释到的unigenes共有8099条,分别注释到207个代谢通路。差异表达基因分析表明,两个花芽分化时期的蝴蝶兰共获得6088条差异表达基因,其中上调表达有3319条,下调表达有2769条。通过查阅文献寻找出36个与蝴蝶兰花芽分化有关的基因,光周期调节途径中得到光敏色素基因PHYA和隐花色素基因CRY1;生物节律相关基因PIF4和EMF1;年龄途径相关基因SPL等;以及开花整合因子基因:CO、FT、LFY等。选取GA序列、FD序列、FT序列、CO序列4个相关基因进行qRT-PCR验证,表达水平与转录组测序结果一致,结果与测序结果相符。本研究为蝴蝶兰花芽调控提供一定的理论指导。
关键词
蝴蝶兰(Phalaenopsis); 转录组测序; 花芽分化; 差异表达基因