研究报告

枇杷果实坐果前后差异基因筛选  

任燕 , 张学英 , 安海山 , 徐芳杰 , 蒋爽*
上海市农业科学院林木果树研究所,上海市设施园艺技术重点实验室,上海, 201403
作者    通讯作者
《分子植物育种》印刷版, 2020 年, 第 18卷, 第 9 篇   
收稿日期: 2019年12月11日    接受日期: 2018年12月19日
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摘 要

枇杷(Eriobotrya japonica)在坐果前后,小果花萼由开放状态转为闭合状态。为获得这一过程中促进果实发育膨大的相关基因,本研究以‘火炬’、‘田中’和‘白玉’开萼和闭萼的果实为试验材料,进行转录组测序分析。共获取 40 Gb测序数据,每个样本的数据量在 6.67~6.88 Gb之间,平均为 6.75 Gb。对测序数据进行重头拼接后获得 37 129Unigene。分离鉴定到了 518个共性差异表达基因。根据注释信息筛选出 16个基因可能与枇杷开闭萼前后促进果实发育有关。其中包括 6大类:WOX 基因、赤霉素相关基因、生长素结合蛋白相关基因、扩张蛋白基因、脱落酸相关基因和乙烯相关基因。前 4类与细胞分裂和增大直接相关,在坐果后发生显著上调表达。后 2类中脱落酸和乙烯均与落果有关,在授粉后,这些基因被显著抑制。每个大类选择1~2个基因进行荧光定量验证,结果显示这些基因的荧光定量结果和转录组的 FPKM值趋势吻合。该研究为枇杷坐果提供重要的分子理论指导,相关的差异基因的挖掘有助于枇杷坐果的分子机制解析。
 

关键词
枇杷;转录组测序;膨大基因;开闭萼
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《分子植物育种》印刷版
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