西北农林科技大学园艺学院,杨凌, 712100
作者 通讯作者
《分子植物育种》印刷版, 2021 年, 第 19卷, 第 9 篇
收稿日期: 2019年12月03日 接受日期: 2019年12月10日 发表日期: 2021年03月15日
作者 通讯作者
《分子植物育种》印刷版, 2021 年, 第 19卷, 第 9 篇
收稿日期: 2019年12月03日 接受日期: 2019年12月10日 发表日期: 2021年03月15日
© 2021 BioPublisher 生命科学中文期刊出版平台
这是一篇采用Creative Commons Attribution License进行授权的开放取阅论文。只要对本原作有恰当的引用,版权所有人允许和同意第三方无条件的使用与传播。
摘 要
14-3-3蛋白是植物中一类高度保守的蛋白家族,因其特异识别并结合靶蛋白的磷酸化位点而广泛参与植物生长发育和逆境胁迫响应过程。为系统地了解 14-3-3 (GRF)基因家族在葫芦科作物中的基本特征和进化关系,本研究利用生物信息学从葫芦科 7个物种基因组内共鉴定出 83个14-3-3 (GRF)基因,其中西瓜中有 10个、甜瓜中 9个、黄瓜中 10个、瓠瓜中 9个,3个南瓜属物种基因组各 15个。理化特性表明14-3-3 (GRF)蛋白的分子量约为 30 kD,且大都为酸性氨基酸(pI<7.0)。相对于西瓜、甜瓜、黄瓜和瓠瓜,基因组复制事件是 3个南瓜属物种内14-3-3 (GRF)基因数目增多的主要原因。进化分析显示,葫芦科 14-3-3 (GRF)基因家族可进一步被划分为ε类和非ε类亚组,且后者的基因结构(外显子数目,内含子相位)较为保守。本研究结果首次完成了 14-3-3 (GRF)基因家族在葫芦科作物的鉴定、基因结构、基因家族扩增、共线性及进化分析,为更深入研究该家族基因的生物学功能提供参考。
关键词
葫芦科;14-3-3 (GRF)基因家族;共线性分析;进化分析