研究报告

欧李ChIRT1基因的克隆与生物信息学分析  

林琳 , 张雪萌 , 郝梦琪 , 郭东林*
哈尔滨师范大学生命科学与技术学院,黑龙江省分子遗传与遗传育种重点实验室,哈尔滨, 150025
作者    通讯作者
《分子植物育种》印刷版, 2021 年, 第 19卷, 第 13 篇   
收稿日期: 2019年12月03日    接受日期: 2019年12月10日    发表日期: 2021年03月16日
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摘 要

欧李(Cerasus humilis)是蔷薇科矮生灌木,果实中的钙、铁等营养物质丰富。铁调转运基因 1 (IRT1)编码的蛋白是 ZIP金属转运家族中主要的铁转运蛋白,负责植物中金属离子的转运,尤其是铁的吸收。本研究从欧李叶片中提取 RNA,逆转录得到 cDNA;参照小金海棠(Malus xiaojinensisMxIRT1 基因设计引物;克隆了欧李ChIRT1 基因,并进行了生物信息学分析。结果表明,ChIRT1 全长 1 417 bp,含有 1678 bp的开放阅读框,编码 226个氨基酸。推测 ChIRT1蛋白的分子量约为 24 kD,理论等电点为 7.72,含有 4个跨膜结构域,属于跨膜蛋白。ChIRT1含有一个 ZIP结构域,二级结构中α- 螺旋占 44.69%,无规则卷曲占 38.94%。系统发育分析表明,欧李的ChIRT1 基因与蔷薇科的IRT1 基因关系密切,与樱桃李(Prunus persica)PpIRT1基因相似度最高。本研究克隆了欧李ChIRT1 基因,并分析了其序列特征,为研究欧李ChIRT1 基因功能及铁调节机制提供了依据。

关键词
欧李(Cerasus humilis);IRT 基因;基因克隆;生物信息学分析
《分子植物育种》印刷版
• 第 19 卷
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