南京农业大学资源与环境科学学院, 江苏省海洋生物学重点实验室, 南京, 210095
作者 通讯作者
《分子植物育种》印刷版, 2021 年, 第 19卷, 第 1 篇
收稿日期: 2019年12月02日 接受日期: 2019年12月06日 发表日期: 2021年03月21日
作者 通讯作者
《分子植物育种》印刷版, 2021 年, 第 19卷, 第 1 篇
收稿日期: 2019年12月02日 接受日期: 2019年12月06日 发表日期: 2021年03月21日
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摘 要
凝集素是生物中普遍存在的一类糖结合蛋白,通过特异识别不同糖基而介导多种生物过程。本研究以‘南菊芋 1 号’为研究材料,克隆并鉴定了 12 个凝集素基因。利用生物信息学分析这些基因编码蛋白的性质表明:等电点为 4.96~5.23,偏酸性;依据其特异性糖基结合域归为三类:8 个属于木菠萝家族(JRL),2 个属于雪花莲家族(GNA),2 个属于卫欧矛家族(EUL);其二级结构主要为无规则卷曲,三级结构主要构象成分为 β片层。基于转录组数据分析表明,根中 HtJRL4/HtGNA2、茎中 HtJRL3、叶中 HtJRL1、初始块茎中 HtEUL1/HtEUL2/HtGNA2 和成熟块茎中 HtJRL6 的表达更为丰富。RT-qPCR 分析显示,多数菊芋凝集素基因在块茎发育的中期和/或后期表达丰度显著高于前期,但各自又呈现较大的变化差异,推测其可能作为块茎的贮藏蛋白或参与信号转导和胁迫感知。本研究结果将为后续深入研究凝集素功能和选育优良菊芋品种提供科学基础。
关键词
植物凝集素;木菠萝家族; 雪花莲家族;卫欧矛家族; 菊芋块茎发育