刘洋¹ , 姚艳丽¹ , 胡小文¹ , 徐磊¹ , 邢淑莲¹ , 张树珍²

1 中国热带农业科学院湛江实验站, 热带旱作农业研究中心, 湛江, 524000;
2 中国热带农业科学院热带生物技术研究所, 甘蔗研究中心, 海口, 571101
作者    通讯作者
《分子植物育种》印刷版, 2014 年, 第 12卷, 第 28 篇   doi: 10.13271/j.mpb.012.001251
收稿日期: 2014年02月22日    接受日期: 2014年08月06日    发表日期: 2014年08月28日

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推荐引用：

Liu Y., Yao Y.L., Hu X.W., Xu L., Xing S.L., and Zhang S.Z., 2014, Isolation and Characterization of Catalase (SsCAT-1) Gene in Saccharum spontaneum L., Fenzi Zhiwu Yuzhong (Molecular Plant Breeding), 12(6): 1251-1258 (刘洋, 姚艳丽, 胡小文, 徐磊, 邢淑莲, 张树珍, 2014, 割手密过氧化氢酶基因(SsCAT-1)的克隆与比较分析, 分子植物育种, 12(6): 1251-1258)

割手密是栽培种甘蔗最重要的近缘物种之一，具有较强的抗逆性。本研究以高粱过氧化氢酶基因(NCBI登录号为XM002437586.1) cDNA序列为探针，对甘蔗EST数据库进行同源检索、筛选和拼接，后经基因组PCR、分子克隆、序列分析验证成功分离了2个割手密过氧化氢酶基因cDNA序列(SsCAT-1c和SsCAT- 1d, GeneBank登录号为KF864229和KF864230)。2条序列全长均为1 532 bp，包含10 bp的5'非翻译区(UTR)和43 bp的3'UTR，以及一个1 479 bp的开放读码框，编码492个氨基酸，此蛋白序列具有过氧化氢酶保守结构域，属于CAT家族。2条序列之间相似性为99.2%，存在12个单核苷酸多态性(SNP)位点，蛋白相似性99.0%，存在5个氨基酸变异位点。将推测的SsCAT-1c和SsCAT-1d蛋白序列与高粱、水稻、玉米等物种进行同源进化分析，均表现出极高的保守性。研究结果能对今后深入了解甘蔗及其近缘材料CAT基因家族的信息提供帮助，从而为进一步通过生物技术改良甘蔗品种抗逆性提供理论依据。

割手密；过氧化氢酶；基因克隆；PCR验证