姜涛 , 刘灵娣 , 田伟 , 谢晓亮 , 温春秀^*

河北省农林科学院经济作物研究所, 石家庄, 050051
作者    通讯作者
《分子植物育种》印刷版, 2021 年, 第 19卷, 第 25 篇   
收稿日期: 2019年11月27日    接受日期: 2019年10月30日    发表日期: 2021年03月23日

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紫苏(Perilla frutescens (L.))是一种药食兼用型的植物，具有丰富的营养价值和药用价值，本研究利用特异性位点扩增片段测序技术(specific-locus amplified fragment sequencing, SLAF-seq)对 30 份紫苏种质资源进行了分子标记开发，以‘日本晴’(水稻)为对照，测序获得紫苏全基因组范围内的 SNP 分子标记。通过测序共获得 106.92 Mb Reads 数据，各样本 Reads 数据在 1 742 153~9 815 872 之间，样本平均测序质量值 Q30为 95.91%；平均 GC 含量为 39.16%。通过生物信息学分析，本研究获得 406 599 个 SLAF 标签，样本的平均测序深度为 19.13 倍，其中多态性的 SLAF 标签共有 140 387 个，共得到 419 223 个群体 SNP 标记。利用开发的 SNP 分子标记将 30 份紫苏种质资源分为 2 组，紫苏 SNP 分子标记的研究可为紫苏的遗传图谱构建、种质资源鉴定以及农艺性状的关联分析提供理论基础。
 

紫苏(Perilla frutescens (L.))；SNP；SLAF-seq 技术； 分子标记