杜泰峰^1,2 , 侯夫云² , 秦桢² , 王庆美² , 张立明^2*

1山东师范大学生命科学学院,济南, 250100; 2山东省农业科学院作物研究所,农业部黄淮海薯类科学观测实验站,济南, 250100
作者    通讯作者
《分子植物育种》印刷版, 2021 年, 第 19卷, 第 6 篇   
收稿日期: 2019年11月24日    接受日期: 2019年11月29日    发表日期: 2021年03月15日

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WRKY 基因家族是一类含有 WRKY保守结构域的转录因子大家族，是植物中最大的转录调控因子家族之一。目前已有多种植物 WRKY家族的分析鉴定报告，但关于甘薯(Ipomoea batatas (L.) Lam.)中WRKY 家族的报告却很少。本研究利用生物信息学方法对甘薯近缘野生种三浅裂野牵牛(Ipomoea trifida (Kunth) G. Don)的基因组数据进行了详细的分析，结果显示：在三浅裂野牵牛基因组中共鉴定得到 82个WRKY转录因子，其中 81个不均匀分布在基因组的 15条染色体上，第 5号染色体上分布最多(10个基因)，第 8和 15号染色体上分布最少(2个基因)；蛋白分子大小在 116~710个氨基酸之间，等电点为 4.85~10.33不等；按照保守结构域分类可以分为Ⅰ、Ⅱ、Ⅲ三组，Ⅱ组包含Ⅱa、Ⅱb、Ⅱc、Ⅱd和Ⅱe五个亚组，其中Ⅰ组有15个ItWRKY 基因、Ⅱa组 4个、Ⅱb组 11个、Ⅱc组 23个、Ⅱd组 7个、Ⅱe组 10个、Ⅲ组 12个；82个ItWRKY 基因中有 8个基因的核心结构域 WRKYGQK发生了单个氨基酸变化(WRKYGKK)。ItWRKY 基因以组织特异性的方式表达且在不同胁迫下基因的表达量存在差异，表明ItWRKY 基因参与了三浅裂野牵牛对胁迫的响应。本研究为甘薯 WRKY基因的功能鉴定提供了参考作用，进一步为甘薯的分子育种提供了帮助。

甘薯近缘野生种；转录因子；WRKY；生物信息学分析