于月华 , 吕宝莲 , 倪志勇^*

新疆农业大学农学院, 乌鲁木齐, 830052
作者    通讯作者
《分子植物育种》印刷版, 2021 年, 第 19卷, 第 2 篇   
收稿日期: 2019年11月24日    接受日期: 2019年11月27日    发表日期: 2021年03月21日

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为了揭示鹰嘴豆 Car-miR156 基因家族的进化过程和表达模式，对 Car-miR156 家族 8 个成员的序列进行生物信息学分析及靶基因预测。染色体定位结果表明 7 个 Car-miR156 基因定位在鹰嘴豆 Ca4、Ca5、Ca6 和 Ca7 四条染色体上，而 Car-miR156g 定位在 scaffold1580 上。序列比对发现 8 个 Car-miR156 基因的成熟序列具有高度一致性，仅在 5' 端第 1、14 和15 个碱基存在差异。二级结构分析结果表明，8 个 Car-miR156成员的前体序列都能形成稳定的茎环结构，Car-miR156h 成熟的 miRNA 序列位于 3' 端，Car-miR156a/b/c/d/e/f/g 成熟的 miRNA 序列位于 5' 端。此外，Car-miR156a/d/f/g 与大豆的 miR156 家族成员亲缘关系较近，Car-miR156e 与拟南芥 Ath-miR156j 聚在一个分支，而 Car-miR156b 单独为一个分支。靶基因预测表明SQUAMOSA 启动子结合蛋白家族成员(SPL2/3/6/7/9/13A)是Car-miR156 的靶基因，Car-miR156a/c/d/e/f/g/h 还
能够靶向调控大刍草颖片架构 1 类基因。转录组数据分析表明，Car-miR156a/c/d/f 在鹰嘴豆 8 个组织中都有表达，Car-miR156b 在根中不表达，Car-miR156e 在茎和花中不表达。这些研究结果为研究鹰嘴豆 Car-miR156家族成员的表达及其靶基因的功能提供了基础。
 

鹰嘴豆；miR156； 靶基因