研究报告

不同地区穇子 ITS序列比较及穇属物种聚类分析  

李基光1,2 , 汤睿2 , 欧立军1 , 王艳兰2 , 王利群2 , 陈光辉1*
1湖南农业大学农学院,长沙, 410128; 2湖南省作物研究所,长沙, 410125
作者    通讯作者
《分子植物育种》印刷版, 2020 年, 第 18卷, 第 16 篇   
收稿日期: 2019年11月19日    接受日期: 2019年11月25日
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摘 要

穇子作为药食兼用的特色作物,对粮食安全和改善人们健康起着重要作用。为探究快速鉴定穇属物种的方法及确定穇子的亲缘关系,本研究对 65个不同产地穇子居群的核糖体 DNA内转录间隔区(ITS)序列进行测序及比对,并构建穇属物种系统发育树。结果发现,穇子 EC25EC53EC593个居群的 ITS序列存在单碱基的突变体,其他居群无任何差异;穇属物种间 ITS存在 3~43个碱基的差异;系统聚类表明,穇属物种分为 2大类 4个亚组,其中穇子与凯芝济穇亲缘关系最近。研究表明,穇子的 ITS序列具有高保守性而穇属种间差异性较大,ITS序列不能作为穇子居群的鉴定标记,可作为穇属物种鉴定的参考序列。本研究为穇子的亲缘关系鉴定及杂交育种提供了分子依据。
 

关键词
穇子(Eleusine coracana); ITS;分子鉴定;聚类分析
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《分子植物育种》印刷版
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