东主南加¹ , 李萍² , 扎西东主 ¹ , 任玉玲² , 加羊洛知³ , 王兆丰 ⁴ , 孙胜男 ^1* , 赵成周^1*

1 青海大学藏医学院, 西宁, 810016; 2 青海大学生态环境工程学院, 西宁, 810016; 3 青海金谷洛智药业有限公司, 黄南, 811300; 4 静宁县食品药品检验检测中心, 平凉, 743400
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《分子植物育种》印刷版, 2021 年, 第 19卷, 第 15 篇   
收稿日期: 2019年11月11日    接受日期: 2019年11月19日    发表日期: 2021年08月16日

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为了深入发掘该基因在尼泊尔黄堇生态适应和次生代谢物积累中的作用机制，本研究依据转录组中葡萄糖 -6- 磷酸脱氢酶(G6PDH)基因的注释信息，应用聚合酶链式反应(PCR)技术克隆了尼泊尔黄堇G6PDH 基因，通过生物信息学方法进行相关分析。结果表明：克隆的 G6PDH 基因的开放阅读框(ORF)为1 581 bp，编码 526 个氨基酸。系统进化树分析表明尼泊尔黄堇 G6PDH 蛋白氨基酸序列与博落回、罂粟等具有很高的相似度，尤其与同是罂粟科的博落回相似度最高，相似度达到 91%。通过一系列生物信息学分析发现，ChG6PDH 蛋白分子量为 59.83 kD；理论等电点为 6.37；该蛋白为不稳定、亲水性、非分泌性蛋白，无跨膜结构域；二级结构中具体 琢- 螺旋(40.11%)和 茁- 折叠 (6.08%)、无规则卷曲 (40.87%)以及延伸链(12.93%)结构，预测得到的三级结构中具有典型的 NADPH 结合位点。该基因的成功克隆和预测结果将为进一步研究ChG6PDH 基因在尼泊尔黄堇生长发育、逆境适应和次生代谢物积累等方面中的功能提供帮助。
 

尼泊尔黄堇(Corydalis hendersonii Hemsl.)；生物信息学分析；葡萄糖 6 磷酸脱氢酶；基因克隆；次生代谢物