陈晓敏¹ , 李书田² , 杨自力¹ , 孙宇燕¹ , 刘斌² , 张立媛² , 王四清¹ , 王丹丹¹ , 郭世华¹

1 内蒙古农业大学农学院, 呼和浩特市, 010019;
2 内蒙古赤峰市农牧科学研究院, 赤峰市, 024031
作者    通讯作者
《分子植物育种》印刷版, 2015 年, 第 13卷, 第 12 篇   doi: 10.13271/j.mpb.013.000098
收稿日期: 2014年02月24日    接受日期: 2014年04月08日    发表日期: 2014年04月17日

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为了明确中国春谷子waxy基因序列的变异，本研究以引进的53份谷子品种(系)为材料，采用PCR产物测序，对waxy基因exon2-exon4序列进行比对分析。研究结果显示：非糯、低直链淀粉含量和糯质类型频率分别为22.6%、54.7%和9.4%；在非糯类型中，11、12、22、23号材料检测到碱基缺失和置换，1、13、18和27号仅存在碱基缺失；在低直链淀粉类型中，9、17和24号同时存在碱基插入、缺失和置换，14和15号品种为碱基缺失和置换，大红谷(00009836)为碱基插入和缺失，20号和43号仅分别出现置换和缺失；在糯质类型中，红粘谷(00000537)同时检测到碱基插入、缺失和置换，杏黄粘存在缺失和置换。根据exon2-exon4区间序列变异，以阈值为78将53份材料聚为十大类，其中第一类品种数量较多，第五类群SNP多态性较丰富。

谷子；waxy；序列比对