三峡大学生物与制药学院, 生物技术研究中心, 宜昌, 443002
作者 通讯作者
《分子植物育种》印刷版, 2020 年, 第 18卷, 第 2 篇
收稿日期: 2019年10月21日 接受日期: 2019年10月24日 发表日期: 2020年12月08日
作者 通讯作者
《分子植物育种》印刷版, 2020 年, 第 18卷, 第 2 篇
收稿日期: 2019年10月21日 接受日期: 2019年10月24日 发表日期: 2020年12月08日
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摘 要
LRR-RLK 家族基因编码的类受体激酶,在植物、动物的抗病过程中起着重要作用,本研究从高粱转录组测序结果中筛选到 1 条具有完整开放阅读框的 LRR-RLK基因序列,设计特异性引物并克隆,通过生物信息学方法分析该基因的序列特征、编码蛋白的理化特性、结构域以及进化关系等,并应用荧光定量PCR技术分析该基因在高粱不同组织中的表达活性。结果表明,克隆得到的LRR-RLK基因开放阅读框为1233 bp,命名为 SbRLK2。SbRLK2编码410 个氨基酸,具有典型的LRR型类受体蛋白激酶结构。DNA 仅与小米及二穗短柄草具有较高同源性,其编码的蛋白与禾本科LRR-RLKs具有较高的同源性。SbRLK2蛋白质理论分子量为 45.017 kDa,理论等电点为 5.85;是稳定疏水性蛋白,具有1个跨膜结构,不存在信号肽;亚细胞预测该基因主要在细胞核(30%)、微体(30%)、和线粒体(10%)中发挥生物学作用。组织特异性表达分析发现,SbRLK2在高粱的花序和叶中高表达,表达量分别是根部的 41.3 倍和 54.3 倍。SbRLK2基因在抗病高粱品种中表达量在接种丝黑穗病菌24h后大幅度增加,72h后表达量有所回落,而在感病品种中的表达量则一直较低,表达差异极显著,说明该基因与高粱的抗丝黑穗病相关。本研究结果为 SbRLK2 基因对高粱抗病的响应模式研究提供了理论参考。
关键词
高粱;SbRLK2 基因克隆;生物信息学;丝黑穗病诱导;表达模式