1 上海市农业科学院林木果树研究所, 上海市设施园艺技术重点实验室, 上海, 201106; 2 上海应用技术大学生态技术与工程学院, 上海,201418; 3 安顺学院农学院, 安顺, 561000
作者 通讯作者
《分子植物育种》印刷版, 2020 年, 第 18卷, 第 25 篇
收稿日期: 2019年10月18日 接受日期: 2019年10月22日 发表日期: 2020年12月11日
作者 通讯作者
《分子植物育种》印刷版, 2020 年, 第 18卷, 第 25 篇
收稿日期: 2019年10月18日 接受日期: 2019年10月22日 发表日期: 2020年12月11日
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摘 要
为筛选西红花不同组织间稳定表达的最佳内参基因,以西红花的根、球茎、主芽、花丝、叶片、侧芽共6 个组织为试验材料,运用实时荧光定量 PCR 方法分析了 18S 核糖体 RNA (18S rRNA)、肌动蛋白基因(ACT)、转录延伸因子 -1琢 (EF1琢)、3- 磷酸 - 甘油醛脱氢酶基因(GAPDH)、微管蛋白基因(TUB)和多聚泛素基因 (UBQ) 共 6 个内参基因在不同组织中的表达差异情况。基于 Ct 值,利用 geNorm、NormFinder 和 BestKeeper 分析 6 个内参基因表达稳定性。结果表明,3 个软件筛选出的最佳内参基因略有不同。综合分析结果
显示,GAPDH 和 UBQ 表达较为稳定,其次为 18S rRNA 和 ACT,而 EF1琢 和 TUB 不适合作为西红花不同组织的内参基因。本研究确定西红花 qRT-PCR 分析的合适内参基因为 GAPDH 和 UBQ,可用于种球发育、花发育、次生代谢产物形成和积累等机理研究。
关键词
西红花(Crocus sativus);不同组织;内参基因;实时荧光定量 PCR