1 青海大学农林科学院, 青海省农林科学院, 青海省青稞遗传育种重点实验室, 国家麦类改良中心青海青稞分中心, 农业农村部作物基因资源与种质创制青海科学观测实验站, 国家作物种质复份库, 西宁, 810016; 2 西藏自治区农牧科学院, 拉萨, 850002; 3 合肥工业大学食品与生物工程学院, 合肥, 230009
作者 通讯作者
《分子植物育种》印刷版, 2021 年, 第 19卷, 第 3 篇
收稿日期: 2019年10月17日 接受日期: 2019年10月22日 发表日期: 2021年03月13日
作者 通讯作者
《分子植物育种》印刷版, 2021 年, 第 19卷, 第 3 篇
收稿日期: 2019年10月17日 接受日期: 2019年10月22日 发表日期: 2021年03月13日
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摘 要
WRKY 是植物中一类重要的转录因子,广泛调控了植物的生长发育和逆境胁迫应答。基于青稞白粉病侵染幼苗的转录组测序数据,本研究鉴定得到 41 个青稞 WRKY 转录因子,被划分为 3 个大组:玉组(6个)、域组(21 个)和芋组(12 个)。另外,HvWRKY40 和 HvWRKY41 没有分组。青稞 WRKY 基因进化分析的聚类结果和分组结果一致,进一步支持了我们分组的正确性。包括 HvWRKY2、HvWRKY8、HvWRKY13、HvWRKY34 和 HvWRKY41,以及 HvWRKY4、HvWRKY7、HvWRKY20、HvWRKY26 和 HvWRKY30 在内的两组 WRKY 基因,表现出明显的先升高(36 h 和 72 h),后降低(168 h)的基因表达趋势。这些 WRKY 基因很可能参与了调控青稞抗白粉病的分子应答机制。青稞 WRKY 家族的蛋白相互作用网络中,HvWRKY3、HvWRKY8、HvWRKY9 属于网络中的主要中心节点。此外,HvWRKY3、HvWRKY8、HvWRKY9、HvWRKY30、HvWRKY34、HvWRKY38、HvWRKY39 彼此之间相互作用,是蛋白互作网络的核心网络。本研究挖掘了青稞的WRKY 家族成员,系统分析了家族成员的分组、家族成员的 WRKY 保守域特点、家族成员之间的进化关系、白粉菌侵染下的基因表达水平和家族成员的蛋白互作网络。本研究可为今后青稞的抗逆研究提供优良的候选 WRKY 基因。
关键词
WRKY;青稞; 转录组;系统进化;蛋白互作网络